O professor Nelio Bizzo tem assessorado diversas escolas privadas e órgãos públicos, no Brasil e no exterior, prestando consultoria na área de metodologia de ensino e benchmarcking de escolas e redes de ensino. Foi consultor do MEC,  coordenando a avaliação de livros didáticos de ciências entre outubro 1995 e fevereiro de 2004, desenvolvendo uma compreensão aprofundada da produção e do consumo de livros didáticos.

O professor Nelio Bizzo coordenou diversos projetos de ensino e pesquisa, na Escola do Futuro da USP, envolvendo escolas de todo o país e do exterior, introduzindo, de maneira pioneira, novas metodologias de ensino no cotidiano dos estudantes de escolas públicas e privadas. O uso da internet na educação fez parte de um de seus projetos pioneiros de ensino e pesquisa.

Entre as escolas e órgãos que solicitaram serviços do professor Nelio Bizzo se destacam a Fundação Roberto Marinho, TV Cultura (SP), Colégio Santa Cruz (SP), Colégio Bandeirantes (SP), Colégio Mater Amabilis (Guarulhos), Colégio Bom Jesus (Curitiba), Escola Técnica Tupy (Joinville), etc. Entre os órgãos públicos podem ser citados o Ministério da Educação ,  INEP, Secretarias de Educação de São Paulo, Paraná e Santa Catarina, e de diversas cidades (São Paulo, Guarulhos, Curitiba).

Os professor Nelio Bizzo presta consultoria a órgãos internacionais, como a UNESCO e IPBES e foi presidente da International Organisation for Science and Technology education (IOSTE).